栽培黑木耳，选择适宜的树种很重要。黑木耳是一种腐生菌，除含有松脂、精油、醇、醚等杀菌物质的树种外，一般阔叶树种大都能生长木耳。虽然这样说，但是树种的选择也会影响黑木耳最终的品相。所以利用食用菌烘干机烘干黑木耳，选择树种的时候就要考虑到这些因素了。
选择树种时应考虑到:重要的经济材木(如漆树、油桐、板栗等)不宜选用，选用树皮厚度适中，不易剥落，边材发达，树木和菌种亲和力强，能获得高产优质的树种；选择树种应就地取材，选择当地资源丰富的树种;最好选用同一树种或几种树种，防止树种过杂，不易管理。
老产区常用的主要耳木大多选用壳斗科、桦木科树种，如麻栎、栓皮栎、檞栎、白栎、米栎、华氏栎、棘皮栎等；白杨、榆树、械树、刺槐、椴树、揪树、悬铃木、柳树、桑树等也是山区常用的树种。
大城市郊区选择树种要因地制宜，就地取材，其树段主要来源有以下几个方面:
(1)果园整枝和更新的树干:如桃、梨、苹果、杏、李等，果园整枝每年能获得大量枝干，可用来栽培木耳。
(2)人行道树修剪下来的枝条:如悬铃木、枫杨、白杨、柳树、榆树、械树等人行道树，遮荫大，剪枝多，每年修剪下来的大量枝条可用来种植木耳。
(3)农村十边树:如刺槐、桑树、乌桕、苦株、椿树等。
质地坚硬的树木，组织紧密，菌丝蔓延慢，子实体形成略迟，但一经发出木耳便可多年收获，质地疏松的树木，菌丝蔓延快，出耳早但不耐久，容易腐烂，产耳年限相对缩短。有些初栽地区，使用大口径或质地坚硬的树木栽培木耳，数月或一年后，未见出耳，往往就认为未成活而丢弃，其实只要管理得当，到适当时候便会大量出耳。这是必须引起注意的。
所以选择栽培黑木耳的客户，一定要慎重选择合适的树种，前期打好基础，后期利用空气能烘干设备烘干，才会有更多的选择余地。
