及时采收猴头，是保证猴头产量和质量的重要一环。当子实体长到八分熟时，也就是猴头上的菌刺长约0.5厘米时，要及时采收，若采收过迟，猴头颜色开始变黄，并散放孢子。此时，柄蒂部分往往有苦味，食用前应掉柄蒂。采收时动作要轻快，不要碰伤子实体。一般用左手握紧菇瓶，右手握住子实体，轻轻旋转拔下。采下来的子实体放在铺有纱布的清洁容器中，以保证子实体完好。采收结束后除去菌柄，在培养基表面轻轻耙一耙，使菌丝得到新鲜空气，刺激下一批子实体尽快形成。一般每瓶能收两次，若管理得好，可以3---4次。
猴头的保存和加工，常用的方法有干藏法和盐渍藏存两种。
(1)干藏法:猴头采收后，放在竹帘上，或用线串挂起来，置于迎风向阳处干燥，如遇连阴天，收获量又较大时，应及时采取烘干措施。有条件的可采用远红外干燥箱。没有烘干设备的地方，可用电炉或火炕烘干。烘干时，要注意尽量保持菌刺完整。猴头吸水性极强，很容易吸潮发霉，经处理后的干猴头，须放在塑料袋内密封保存，以保证其质量如初。
(2)盐渍藏存法:将新鲜的猴头切去菌柄，用清水漂洗，除去灰尘，放入1/1000的柠檬酸溶液中煮沸10分钟，捞出后置于清水中冷却，控去水分，加入食盐，藏存于缸中，上压竹木，使猴头全部浸入盐水中。食用时再用清水漫泡脱盐，也可以考虑制成罐头食品。
在采收猴头菇的同时，我们也要考虑到期保存需求，对于需要烘干的猴头菇来说，利用食用菌烘干机进行烘干，然后再予以保存是非常有必要的一件事情。只有保证每个步骤的细节，才能做出大家满意的产品。
