在平菇生长过程中，杂菌的存在是不可避免的，想要利用食用菌烘干机烘干出来好品相的平菇，就要在平菇生长过程中做好准备。
平菇生产的各个环节，都有可能遭受杂菌污染，必须及时防治。常见的杂菌主要有以下几种:
(1)细菌:污染多数发生在母种斜面上，对原种、栽培种危害都比较轻。细菌污染的特点是:繁殖快，一般接种后10---24小时就能表现出来。
防治方法:
一是试管冷凝水干后再开始接种；
二是接种针一定要用火焰灭菌；
三是培养温度不能高于25℃；
四是斜面培养好后放置24小时，观察确无细菌污染再接菌种。
(2)青霉和木霉:青霉菌危害常见于原种和栽培种，侵入后很快萌发成菌丝，覆盖在培养基表面，木霉菌生长在子实体形成期。出现这两种杂菌时，应及时挖除。
青雄菌:初期和平菇一样，长出白色菌丝，但不久就产生青色的孢子，这种菌的繁殖温度是30℃左右。因此，在夏季高温时节，要特别注意青霉菌的防治。
木霉菌:初期为白色致密的平坦菌丝，而后在基质边绿出现绿色，在温度3℃左右繁殖很快。
(3)毛霉和根霉:这两种杂菌发生污染时间较早，一般播菌后4---5天就开始发现灰白色的菌丝并很快形成大量黑色孢子，危害平菇，应及时挖除。
大毛霉菌:这种霉菌的繁殖力很强，只要3---5天，就能长满全畦，大毛霉菌菌丝发生初期为白色，以后产生黑色的孢子，繁殖温度为30℃左右。
(4)黄曲霉菌:在高温高湿的环境中易发生，产生大最黄色孢子，对人体有害，应及时防治。
(5)链孢霉菌:在夏季高温季节容易发生，产生大量桔红色粉状孢子，危害极大。可用0.05%高锰酸钾溶液浸泡瓶子后使用。
防治方法:青霉菌、木霉菌和大毛霉菌是平菇栽培中发生最普遍的杂菌，但它们的繁殖温度都比平菇高。因此，要特别注意温度的调节。一旦发现杂菌污染，应及时将杂菌部位的培养基清除掉。杂菌周围的培养料，可用酒精棉球消毒，也可用0.1%---0.2%的多菌灵消毒。若杂菌面积超过所种面积的20%，就应将培养料全部消除干净，深埋或烧掉。采用药剂防治杂菌，对平菇生长发育都有一定的影响，所以最根本的是让平菇菌丝尽快地在培养料中繁殖起来，以增强抵抗杂菌的能力。此外，还应注意以下几点:
(1)选用优良健壮的菌种，以提高抵抗杂菌侵入的能力。
(2)控制好阶段培养条件，如拌料水分、松紧度。
(3)培养室温度不易过高，应保持在20---27℃之间。
(4)保持周围环境卫生，培养室要注意通风换气。
(5)发生链孢霉菌污染时，用具要彻底灭菌，以防蔓延，并适当加大菌种播种量。
在平菇生长的阶段，一定要细心小心，只有保证了平菇的质量，才能利用食用菌烘干机烘干出高品相的平菇。
